Une convention de recherche et de coopération scientifique a été signée en 2011 entre l'Université Paris IV - Sorbonne et le Musée national de la Marine définissant les modalités de la collaboration entre le Musée et la FED 4124 Histoire et Archéologie Maritimes.
La signature de cette convention conforte encore les relations profondes qu'ont tissées l'université Paris-Sorbonne et le Musée national de la Marine depuis 1997, travaillant en partenariat au développement de l'histoire et de l'archéologie maritimes en France.
Les membres de la FED Histoire et Archéologie Maritimes peuvent ainsi, à la demande du Musée, apporter leur concours scientifique en histoire ou histoire de l'art maritime sur des thèmes de recherche en vue d'expositions permanentes ou temporaires, de manifestations et de séminaires.
Dans le domaine scientifique couvert par la FED, ils peuvent éventuellement bénéficier d'un programme de soutien financier de leurs publications mis en place par la FED Histoire et Archéologie Maritimes avec le concours du Musée national de la Marine.